En la Planta Agroindustrial de Investigación y Desarrollo se cuenta con diferentes departamentos en los cuales se realizan investigaciones científicas y de desarrollo en las siguientes áreas de producción: Procesamiento de Lácteos Cárnicos, Procesamiento de Semillas, Procesamiento de productos Hortofrutícolas, Procesamiento de Mieles y derivados.

Cada uno de estos departamentos sirven como apoyo técnico y de investigación y trabaja en paralelo con la Planta Agroindustrial de Investigación y Desarrollo al momento de prestar servicios externos al igual que en labores educativas.